Conserved Protein Domain Family
SEEEED

?
pfam14797: SEEEED 
Serine-rich region of AP3B1, clathrin-adaptor complex
This short low-complexity, highly serine-rich region lies on clathrin-adaptor complex 3 beta-1 subunit proteins, between family Adaptin_N, pfam01602 and a C-terminal domain, AP3B1_C,pfam14796.
Statistics
?
PSSM-Id: 434218
Aligned: 16 rows
Threshold Bit Score: 39.1411
Created: 25-Mar-2022
Updated: 17-Oct-2022
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
XP_017194124  672 PAKKFYSEseEEEDS-------SDSSSESESESGSESEEE----ADSSEDSSASSPNEQEGESASESEgrSKRTAKKSWK 740 
2_pfamImport    1 REEQFYSE--EEVSGsggsnnsSSSSSGSESSSESEEESEgk-kASSSEDSHNSSSDGEKSESESELE--KKGTRKRNHL 75  
XP_013002052  771 PAKKFYSEseEEEDS-------SDSSSDSESESESESGEDs---MDSSEDSSEESSSEQNSESGSATEaeDKAPTKRSSE 840 
EHB00108      686 PSKKFYSEseEEEDS-------SDSGSDSESESGSESGDDgassEDTSEDS-EDSSNEQESENGSVAE--DKAATKRNPE 755 
XP_007658162  624 LDEKFYSEseEEEES-------SSSNSGSESESSSESEVSgk-kDSSSEDSSEDSSSESESESESENQ---KGTAKLKSK 692 
XP_005060792  624 PTEKFYSEseEEEDE-------SASTSSSGSGSDSESEKEdkeeGSTDESSGSSSPSEESTDSESDSR---ESAAKKTCR 693 
XP_027302495  633 PTEKFYSEseEEEDE-------SASTSATESESGSESEKEdkeeGSSDESSESSSSSEESSDSESDSK---ESIAKKASG 702 
XP_003643003  675 PTEKFYSEseEEEED-------SASTSATESESGSESEKErkeeSSSNESSESSSSTGVSSDSESE-----ESTEKKTSG 742 
XP_003498747  670 PAKKFYSEseEEEAEee---esSDSSSDSEGESGSESGDT----GSSSEDSSEDSSSGQESETGSEAEaeGKRAGKRNSR 742 
Q9Z1T1        683 EEDEDEDEdeEEEEKededenpSDSSSDSESGSGSESGDT------GTEDSSEDSSSGQDSETGSQAEaeRQKVAKRNSK 756  house mouse
XP_017194124  741 TRAKSDSEDEEKE----NEKSKSSDSSSAESSSAEGSSSDAESES 781 
2_pfamImport   76 DKSRSEGEKRGKK----SSKKKDYSSSDSESSSSEDSLSETESES 116 
XP_013002052  841 TRGKSDSEDGKKK----NKKSKTSDSSNAESSSVEESS--SESES 879 
EHB00108      756 TKGESDSEDGEKK----NKKSQTSDSSNVESSSIEESS--SESES 794 
XP_007658162  693 SVQESASDPDKMK----TRKLEDSGSSNSDSSSGEESS--SESES 731 
XP_005060792  694 AVNESDSEDIKKKaegvSKKRSTSSSSDTEYTSSDESSTGSKSES 738 
XP_027302495  703 AVKESNAEEIKRKakgiSKNRNTSSSSDTVSSSSEESSSDSKSVS 747 
XP_003643003  743 AAEESDSEDIKKKakeiSKSRSTFSSSDTESSSSEESSSNSKSES 787 
XP_003498747  743 LKRKSDSEDGEKK----NEKSKTSESSSAESSSMEESSSGSESAS 783 
Q9Z1T1        757 TKRKSDSENREKK----NENSKASESSSEESSSMEDSSSESESES 797  house mouse
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap